Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIPK1Q13546 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RIPK1Q13546 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RIPK1Q13546 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RIPK1Q13546 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RIPK1Q13546 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RIPK1Q13546 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RIPK1Q13546 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RIPK1Q13546 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RIPK1Q13546 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RIPK1Q13546 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RIPK1Q13546 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RIPK1Q13546 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RIPK1Q13546 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK1Q13546 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK1Q13546 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK1Q13546 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RIPK1Q13546 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RIPK1Q13546 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RIPK1Q13546 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RIPK1Q13546 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RIPK1Q13546 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RIPK1Q13546 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RIPK1Q13546 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RIPK1Q13546 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIPK1Q13546 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIPK1Q13546 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RIPK1Q13546 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RIPK1Q13546 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIPK1Q13546 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RIPK1Q13546 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RIPK1Q13546 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK1Q13546 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK1Q13546 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RIPK1Q13546 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK1Q13546 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIPK1Q13546 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIPK1Q13546 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIPK1Q13546 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIPK1Q13546 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIPK1Q13546 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIPK1Q13546 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK1Q13546 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK1Q13546 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK1Q13546 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIPK1Q13546 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIPK1Q13546 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK1Q13546 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIPK1Q13546 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIPK1Q13546 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIPK1Q13546 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RIPK1Q13546 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIPK1Q13546 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK1Q13546 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK1Q13546 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RIPK1Q13546 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK1Q13546 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK1Q13546 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK1Q13546 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK1Q13546 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK1Q13546 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK1Q13546 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK1Q13546 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK1Q13546 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK1Q13546 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIPK1Q13546 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RIPK1Q13546 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK1Q13546 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK1Q13546 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK1Q13546 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK1Q13546 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIPK1Q13546 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIPK1Q13546 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIPK1Q13546 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK1Q13546 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK1Q13546 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK1Q13546 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIPK1Q13546 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIPK1Q13546 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK1Q13546 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK1Q13546 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK1Q13546 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK1Q13546 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK1Q13546 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK1Q13546 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK1Q13546 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK1Q13546 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK1Q13546 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK1Q13546 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK1Q13546 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK1Q13546 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK1Q13546 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK1Q13546 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RIPK1Q13546 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK1Q13546 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK1Q13546 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIPK1Q13546 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK1Q13546 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK1Q13546 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK1Q13546 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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