Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PRPF4BQ13523 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRPF4BQ13523 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRPF4BQ13523 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRPF4BQ13523 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PRPF4BQ13523 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRPF4BQ13523 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRPF4BQ13523 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRPF4BQ13523 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PRPF4BQ13523 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRPF4BQ13523 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF4BQ13523 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF4BQ13523 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF4BQ13523 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF4BQ13523 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF4BQ13523 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF4BQ13523 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF4BQ13523 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPF4BQ13523 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF4BQ13523 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF4BQ13523 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRPF4BQ13523 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF4BQ13523 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF4BQ13523 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF4BQ13523 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF4BQ13523 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF4BQ13523 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF4BQ13523 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF4BQ13523 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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