Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MKRN4PQ13434 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKRN4PQ13434 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKRN4PQ13434 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKRN4PQ13434 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MKRN4PQ13434 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MKRN4PQ13434 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
MKRN4PQ13434 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MKRN4PQ13434 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKRN4PQ13434 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MKRN4PQ13434 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MKRN4PQ13434 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MKRN4PQ13434 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MKRN4PQ13434 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MKRN4PQ13434 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MKRN4PQ13434 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MKRN4PQ13434 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MKRN4PQ13434 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKRN4PQ13434 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MKRN4PQ13434 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MKRN4PQ13434 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MKRN4PQ13434 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MKRN4PQ13434 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MKRN4PQ13434 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MKRN4PQ13434 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MKRN4PQ13434 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
MKRN4PQ13434 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MKRN4PQ13434 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MKRN4PQ13434 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MKRN4PQ13434 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MKRN4PQ13434 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MKRN4PQ13434 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MKRN4PQ13434 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MKRN4PQ13434 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MKRN4PQ13434 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MKRN4PQ13434 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN4PQ13434 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
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