Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SELENBP1Q13228 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENBP1Q13228 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENBP1Q13228 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENBP1Q13228 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENBP1Q13228 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENBP1Q13228 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENBP1Q13228 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENBP1Q13228 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENBP1Q13228 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENBP1Q13228 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SELENBP1Q13228 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SELENBP1Q13228 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENBP1Q13228 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SELENBP1Q13228 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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