Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NFIAQ12857 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NFIAQ12857 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NFIAQ12857 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NFIAQ12857 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NFIAQ12857 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NFIAQ12857 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NFIAQ12857 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NFIAQ12857 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NFIAQ12857 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NFIAQ12857 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NFIAQ12857 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NFIAQ12857 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NFIAQ12857 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NFIAQ12857 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NFIAQ12857 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NFIAQ12857 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NFIAQ12857 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NFIAQ12857 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NFIAQ12857 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NFIAQ12857 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NFIAQ12857 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NFIAQ12857 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NFIAQ12857 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NFIAQ12857 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NFIAQ12857 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NFIAQ12857 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NFIAQ12857 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NFIAQ12857 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NFIAQ12857 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NFIAQ12857 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIAQ12857 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIAQ12857 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NFIAQ12857 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NFIAQ12857 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NFIAQ12857 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NFIAQ12857 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NFIAQ12857 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NFIAQ12857 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NFIAQ12857 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NFIAQ12857 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NFIAQ12857 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NFIAQ12857 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NFIAQ12857 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NFIAQ12857 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NFIAQ12857 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NFIAQ12857 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NFIAQ12857 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NFIAQ12857 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NFIAQ12857 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NFIAQ12857 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFIAQ12857 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFIAQ12857 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFIAQ12857 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
NFIAQ12857 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NFIAQ12857 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NFIAQ12857 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NFIAQ12857 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NFIAQ12857 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NFIAQ12857 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFIAQ12857 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
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