Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLEQ07864 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLEQ07864 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLEQ07864 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLEQ07864 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLEQ07864 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLEQ07864 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLEQ07864 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLEQ07864 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLEQ07864 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLEQ07864 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLEQ07864 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLEQ07864 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLEQ07864 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLEQ07864 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLEQ07864 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLEQ07864 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLEQ07864 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLEQ07864 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLEQ07864 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLEQ07864 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLEQ07864 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLEQ07864 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLEQ07864 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLEQ07864 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLEQ07864 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLEQ07864 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLEQ07864 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLEQ07864 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLEQ07864 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLEQ07864 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLEQ07864 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLEQ07864 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLEQ07864 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLEQ07864 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLEQ07864 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLEQ07864 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLEQ07864 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLEQ07864 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLEQ07864 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLEQ07864 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLEQ07864 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLEQ07864 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLEQ07864 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLEQ07864 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLEQ07864 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLEQ07864 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLEQ07864 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLEQ07864 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLEQ07864 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLEQ07864 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLEQ07864 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLEQ07864 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLEQ07864 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLEQ07864 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLEQ07864 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLEQ07864 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLEQ07864 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLEQ07864 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLEQ07864 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLEQ07864 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLEQ07864 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLEQ07864 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLEQ07864 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLEQ07864 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLEQ07864 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLEQ07864 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLEQ07864 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLEQ07864 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLEQ07864 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLEQ07864 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLEQ07864 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLEQ07864 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLEQ07864 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLEQ07864 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLEQ07864 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLEQ07864 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLEQ07864 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLEQ07864 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLEQ07864 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLEQ07864 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLEQ07864 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLEQ07864 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLEQ07864 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLEQ07864 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLEQ07864 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLEQ07864 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLEQ07864 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLEQ07864 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLEQ07864 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLEQ07864 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLEQ07864 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLEQ07864 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLEQ07864 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLEQ07864 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLEQ07864 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLEQ07864 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLEQ07864 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLEQ07864 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLEQ07864 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms