Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL8P80075 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL8P80075 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL8P80075 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL8P80075 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL8P80075 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL8P80075 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL8P80075 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL8P80075 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL8P80075 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL8P80075 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL8P80075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL8P80075 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL8P80075 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL8P80075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL8P80075 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL8P80075 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL8P80075 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL8P80075 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL8P80075 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL8P80075 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL8P80075 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL8P80075 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL8P80075 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL8P80075 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL8P80075 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL8P80075 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL8P80075 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL8P80075 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL8P80075 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL8P80075 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL8P80075 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL8P80075 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL8P80075 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL8P80075 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL8P80075 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL8P80075 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL8P80075 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL8P80075 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL8P80075 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL8P80075 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL8P80075 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL8P80075 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL8P80075 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL8P80075 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL8P80075 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL8P80075 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL8P80075 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL8P80075 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL8P80075 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL8P80075 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL8P80075 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL8P80075 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL8P80075 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL8P80075 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL8P80075 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL8P80075 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL8P80075 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL8P80075 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL8P80075 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL8P80075 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL8P80075 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL8P80075 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL8P80075 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL8P80075 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL8P80075 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL8P80075 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL8P80075 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL8P80075 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL8P80075 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL8P80075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL8P80075 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL8P80075 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL8P80075 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL8P80075 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL8P80075 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL8P80075 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL8P80075 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL8P80075 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL8P80075 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL8P80075 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL8P80075 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL8P80075 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL8P80075 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL8P80075 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL8P80075 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL8P80075 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL8P80075 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL8P80075 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL8P80075 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL8P80075 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL8P80075 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL8P80075 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL8P80075 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL8P80075 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL8P80075 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL8P80075 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL8P80075 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL8P80075 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL8P80075 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms