Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX4P78413 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX4P78413 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX4P78413 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX4P78413 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX4P78413 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX4P78413 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX4P78413 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX4P78413 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX4P78413 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX4P78413 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX4P78413 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX4P78413 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX4P78413 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX4P78413 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX4P78413 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX4P78413 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX4P78413 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX4P78413 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX4P78413 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX4P78413 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX4P78413 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX4P78413 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX4P78413 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX4P78413 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX4P78413 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX4P78413 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX4P78413 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX4P78413 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX4P78413 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX4P78413 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX4P78413 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX4P78413 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX4P78413 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX4P78413 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX4P78413 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX4P78413 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX4P78413 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX4P78413 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX4P78413 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX4P78413 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX4P78413 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX4P78413 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX4P78413 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX4P78413 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX4P78413 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX4P78413 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX4P78413 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX4P78413 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX4P78413 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX4P78413 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX4P78413 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX4P78413 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX4P78413 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX4P78413 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX4P78413 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX4P78413 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX4P78413 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX4P78413 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX4P78413 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX4P78413 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX4P78413 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX4P78413 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX4P78413 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX4P78413 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX4P78413 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX4P78413 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX4P78413 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX4P78413 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX4P78413 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX4P78413 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX4P78413 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX4P78413 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX4P78413 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX4P78413 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX4P78413 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX4P78413 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX4P78413 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX4P78413 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX4P78413 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX4P78413 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX4P78413 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX4P78413 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX4P78413 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX4P78413 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX4P78413 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX4P78413 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX4P78413 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX4P78413 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX4P78413 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX4P78413 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX4P78413 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX4P78413 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX4P78413 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX4P78413 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX4P78413 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX4P78413 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX4P78413 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX4P78413 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX4P78413 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms