Protein–RNA interactions for Protein: P78318

IGBP1, Immunoglobulin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGBP1P78318 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
IGBP1P78318 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IGBP1P78318 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IGBP1P78318 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IGBP1P78318 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IGBP1P78318 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
IGBP1P78318 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IGBP1P78318 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
IGBP1P78318 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IGBP1P78318 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IGBP1P78318 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IGBP1P78318 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IGBP1P78318 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IGBP1P78318 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IGBP1P78318 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IGBP1P78318 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IGBP1P78318 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IGBP1P78318 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
IGBP1P78318 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IGBP1P78318 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
IGBP1P78318 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IGBP1P78318 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IGBP1P78318 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IGBP1P78318 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IGBP1P78318 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IGBP1P78318 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IGBP1P78318 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IGBP1P78318 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IGBP1P78318 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGBP1P78318 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IGBP1P78318 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IGBP1P78318 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGBP1P78318 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms