Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP2P78314 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SH3BP2P78314 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH3BP2P78314 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2P78314 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2P78314 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH3BP2P78314 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2P78314 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2P78314 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2P78314 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BP2P78314 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH3BP2P78314 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2P78314 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2P78314 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2P78314 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2P78314 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms