Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1A1P68104 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1A1P68104 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1A1P68104 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1A1P68104 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEF1A1P68104 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEF1A1P68104 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEF1A1P68104 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEF1A1P68104 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1A1P68104 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEF1A1P68104 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1A1P68104 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1A1P68104 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1A1P68104 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1A1P68104 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEF1A1P68104 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1A1P68104 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1A1P68104 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1A1P68104 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1A1P68104 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1A1P68104 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1A1P68104 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1A1P68104 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1A1P68104 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEF1A1P68104 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms