Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKP1P63208 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SKP1P63208 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKP1P63208 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKP1P63208 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKP1P63208 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKP1P63208 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKP1P63208 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKP1P63208 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKP1P63208 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKP1P63208 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKP1P63208 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKP1P63208 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKP1P63208 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKP1P63208 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKP1P63208 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKP1P63208 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKP1P63208 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKP1P63208 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKP1P63208 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKP1P63208 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKP1P63208 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SKP1P63208 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKP1P63208 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKP1P63208 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKP1P63208 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKP1P63208 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKP1P63208 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKP1P63208 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKP1P63208 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKP1P63208 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKP1P63208 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKP1P63208 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKP1P63208 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKP1P63208 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKP1P63208 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKP1P63208 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKP1P63208 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKP1P63208 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKP1P63208 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKP1P63208 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKP1P63208 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKP1P63208 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKP1P63208 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKP1P63208 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKP1P63208 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SKP1P63208 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKP1P63208 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKP1P63208 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKP1P63208 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SKP1P63208 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKP1P63208 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKP1P63208 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKP1P63208 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKP1P63208 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKP1P63208 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SKP1P63208 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKP1P63208 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKP1P63208 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKP1P63208 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKP1P63208 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKP1P63208 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKP1P63208 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKP1P63208 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKP1P63208 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKP1P63208 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKP1P63208 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SKP1P63208 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKP1P63208 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKP1P63208 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKP1P63208 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKP1P63208 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKP1P63208 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKP1P63208 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKP1P63208 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKP1P63208 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKP1P63208 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKP1P63208 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKP1P63208 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKP1P63208 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKP1P63208 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKP1P63208 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKP1P63208 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SKP1P63208 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKP1P63208 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKP1P63208 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKP1P63208 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKP1P63208 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKP1P63208 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKP1P63208 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKP1P63208 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKP1P63208 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKP1P63208 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SKP1P63208 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SKP1P63208 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKP1P63208 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKP1P63208 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKP1P63208 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKP1P63208 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKP1P63208 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms