Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL23AP62750 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL23AP62750 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL23AP62750 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL23AP62750 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL23AP62750 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL23AP62750 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL23AP62750 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL23AP62750 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL23AP62750 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL23AP62750 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL23AP62750 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL23AP62750 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL23AP62750 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms