Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSX2P58304 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSX2P58304 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSX2P58304 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSX2P58304 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSX2P58304 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSX2P58304 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VSX2P58304 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSX2P58304 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSX2P58304 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSX2P58304 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSX2P58304 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VSX2P58304 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSX2P58304 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSX2P58304 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSX2P58304 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSX2P58304 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSX2P58304 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VSX2P58304 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VSX2P58304 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VSX2P58304 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSX2P58304 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSX2P58304 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSX2P58304 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VSX2P58304 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSX2P58304 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSX2P58304 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSX2P58304 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSX2P58304 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSX2P58304 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSX2P58304 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSX2P58304 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VSX2P58304 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSX2P58304 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSX2P58304 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSX2P58304 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSX2P58304 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSX2P58304 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSX2P58304 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSX2P58304 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSX2P58304 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSX2P58304 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VSX2P58304 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSX2P58304 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSX2P58304 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSX2P58304 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSX2P58304 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSX2P58304 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSX2P58304 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSX2P58304 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSX2P58304 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSX2P58304 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSX2P58304 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSX2P58304 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSX2P58304 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSX2P58304 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSX2P58304 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSX2P58304 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSX2P58304 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSX2P58304 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSX2P58304 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSX2P58304 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSX2P58304 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSX2P58304 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSX2P58304 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSX2P58304 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSX2P58304 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSX2P58304 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSX2P58304 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSX2P58304 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSX2P58304 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSX2P58304 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSX2P58304 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VSX2P58304 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSX2P58304 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSX2P58304 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSX2P58304 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSX2P58304 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VSX2P58304 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSX2P58304 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VSX2P58304 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSX2P58304 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSX2P58304 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSX2P58304 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSX2P58304 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSX2P58304 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VSX2P58304 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSX2P58304 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSX2P58304 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSX2P58304 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSX2P58304 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSX2P58304 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSX2P58304 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSX2P58304 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSX2P58304 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSX2P58304 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSX2P58304 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSX2P58304 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VSX2P58304 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSX2P58304 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms