Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1B3P54709 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1B3P54709 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1B3P54709 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP1B3P54709 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1B3P54709 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B3P54709 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1B3P54709 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1B3P54709 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1B3P54709 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1B3P54709 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms