Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAA2P54646 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAA2P54646 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAA2P54646 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAA2P54646 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAA2P54646 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAA2P54646 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAA2P54646 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAA2P54646 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAA2P54646 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAA2P54646 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAA2P54646 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKAA2P54646 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAA2P54646 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKAA2P54646 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKAA2P54646 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKAA2P54646 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAA2P54646 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAA2P54646 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAA2P54646 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAA2P54646 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAA2P54646 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAA2P54646 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAA2P54646 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms