Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATXN1P54253 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATXN1P54253 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATXN1P54253 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATXN1P54253 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATXN1P54253 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATXN1P54253 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATXN1P54253 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATXN1P54253 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATXN1P54253 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATXN1P54253 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATXN1P54253 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATXN1P54253 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATXN1P54253 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATXN1P54253 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATXN1P54253 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATXN1P54253 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATXN1P54253 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATXN1P54253 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATXN1P54253 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATXN1P54253 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATXN1P54253 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATXN1P54253 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATXN1P54253 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATXN1P54253 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATXN1P54253 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATXN1P54253 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATXN1P54253 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATXN1P54253 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN1P54253 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATXN1P54253 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN1P54253 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN1P54253 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN1P54253 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATXN1P54253 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATXN1P54253 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN1P54253 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATXN1P54253 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN1P54253 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATXN1P54253 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATXN1P54253 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms