Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK3P51956 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK3P51956 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK3P51956 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK3P51956 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK3P51956 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK3P51956 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK3P51956 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK3P51956 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK3P51956 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK3P51956 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK3P51956 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK3P51956 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK3P51956 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK3P51956 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK3P51956 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK3P51956 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK3P51956 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK3P51956 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK3P51956 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK3P51956 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK3P51956 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK3P51956 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK3P51956 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK3P51956 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK3P51956 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK3P51956 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK3P51956 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK3P51956 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK3P51956 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK3P51956 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK3P51956 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK3P51956 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK3P51956 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK3P51956 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK3P51956 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK3P51956 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK3P51956 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK3P51956 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK3P51956 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK3P51956 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK3P51956 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK3P51956 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK3P51956 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK3P51956 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK3P51956 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK3P51956 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK3P51956 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK3P51956 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK3P51956 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK3P51956 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK3P51956 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK3P51956 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK3P51956 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK3P51956 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK3P51956 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK3P51956 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEK3P51956 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEK3P51956 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEK3P51956 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK3P51956 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK3P51956 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK3P51956 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK3P51956 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK3P51956 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK3P51956 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK3P51956 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK3P51956 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK3P51956 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK3P51956 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK3P51956 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK3P51956 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK3P51956 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK3P51956 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK3P51956 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK3P51956 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK3P51956 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK3P51956 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK3P51956 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK3P51956 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK3P51956 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK3P51956 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK3P51956 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK3P51956 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK3P51956 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK3P51956 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK3P51956 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEK3P51956 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK3P51956 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK3P51956 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK3P51956 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK3P51956 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK3P51956 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK3P51956 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK3P51956 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK3P51956 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK3P51956 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK3P51956 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK3P51956 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK3P51956 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms