Protein–RNA interactions for Protein: P51686

CCR9, C-C chemokine receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR9P51686 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR9P51686 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR9P51686 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR9P51686 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR9P51686 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR9P51686 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR9P51686 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR9P51686 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR9P51686 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR9P51686 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR9P51686 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR9P51686 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR9P51686 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR9P51686 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR9P51686 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR9P51686 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR9P51686 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCR9P51686 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR9P51686 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR9P51686 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR9P51686 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR9P51686 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR9P51686 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR9P51686 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR9P51686 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR9P51686 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR9P51686 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR9P51686 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR9P51686 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR9P51686 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR9P51686 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR9P51686 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR9P51686 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR9P51686 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR9P51686 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR9P51686 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR9P51686 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR9P51686 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR9P51686 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR9P51686 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR9P51686 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR9P51686 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR9P51686 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR9P51686 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR9P51686 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR9P51686 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR9P51686 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR9P51686 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR9P51686 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR9P51686 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR9P51686 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR9P51686 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR9P51686 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR9P51686 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR9P51686 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR9P51686 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR9P51686 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR9P51686 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR9P51686 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR9P51686 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR9P51686 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR9P51686 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR9P51686 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR9P51686 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR9P51686 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR9P51686 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR9P51686 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR9P51686 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR9P51686 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR9P51686 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR9P51686 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR9P51686 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR9P51686 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR9P51686 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR9P51686 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR9P51686 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR9P51686 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR9P51686 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR9P51686 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR9P51686 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR9P51686 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR9P51686 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR9P51686 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR9P51686 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR9P51686 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR9P51686 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR9P51686 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR9P51686 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR9P51686 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR9P51686 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR9P51686 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR9P51686 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR9P51686 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR9P51686 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR9P51686 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR9P51686 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR9P51686 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR9P51686 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR9P51686 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR9P51686 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms