Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCR5P51681 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCR5P51681 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCR5P51681 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCR5P51681 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCR5P51681 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCR5P51681 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCR5P51681 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCR5P51681 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCR5P51681 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCR5P51681 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCR5P51681 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCR5P51681 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCR5P51681 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCR5P51681 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCR5P51681 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCR5P51681 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCR5P51681 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCR5P51681 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCR5P51681 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCR5P51681 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCR5P51681 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCR5P51681 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCR5P51681 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCR5P51681 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCR5P51681 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCR5P51681 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCR5P51681 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCR5P51681 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCR5P51681 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCR5P51681 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCR5P51681 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCR5P51681 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCR5P51681 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR5P51681 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR5P51681 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR5P51681 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR5P51681 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCR5P51681 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR5P51681 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR5P51681 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCR5P51681 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR5P51681 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR5P51681 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCR5P51681 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCR5P51681 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCR5P51681 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCR5P51681 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCR5P51681 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCR5P51681 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCR5P51681 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCR5P51681 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCR5P51681 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCR5P51681 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCR5P51681 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCR5P51681 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCR5P51681 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCR5P51681 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCR5P51681 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR5P51681 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR5P51681 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR5P51681 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR5P51681 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR5P51681 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCR5P51681 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR5P51681 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR5P51681 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR5P51681 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCR5P51681 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCR5P51681 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR5P51681 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR5P51681 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR5P51681 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCR5P51681 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCR5P51681 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR5P51681 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR5P51681 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR5P51681 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR5P51681 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCR5P51681 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCR5P51681 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCR5P51681 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCR5P51681 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCR5P51681 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCR5P51681 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCR5P51681 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCR5P51681 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCR5P51681 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCR5P51681 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCR5P51681 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCR5P51681 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCR5P51681 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCR5P51681 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCR5P51681 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCR5P51681 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCR5P51681 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCR5P51681 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCR5P51681 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCR5P51681 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCR5P51681 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.1 ms