Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB13P51153 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB13P51153 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB13P51153 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB13P51153 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB13P51153 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB13P51153 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB13P51153 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB13P51153 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB13P51153 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB13P51153 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB13P51153 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB13P51153 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB13P51153 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB13P51153 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB13P51153 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB13P51153 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB13P51153 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB13P51153 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB13P51153 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB13P51153 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB13P51153 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB13P51153 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB13P51153 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB13P51153 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB13P51153 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB13P51153 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB13P51153 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB13P51153 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB13P51153 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB13P51153 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB13P51153 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB13P51153 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB13P51153 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB13P51153 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB13P51153 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB13P51153 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB13P51153 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB13P51153 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB13P51153 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB13P51153 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB13P51153 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB13P51153 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB13P51153 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB13P51153 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB13P51153 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB13P51153 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB13P51153 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB13P51153 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB13P51153 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB13P51153 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB13P51153 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB13P51153 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB13P51153 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB13P51153 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB13P51153 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB13P51153 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB13P51153 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB13P51153 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB13P51153 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB13P51153 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB13P51153 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB13P51153 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB13P51153 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB13P51153 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB13P51153 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB13P51153 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB13P51153 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB13P51153 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB13P51153 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB13P51153 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB13P51153 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB13P51153 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB13P51153 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB13P51153 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB13P51153 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB13P51153 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB13P51153 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB13P51153 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB13P51153 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB13P51153 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB13P51153 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB13P51153 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB13P51153 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB13P51153 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB13P51153 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB13P51153 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB13P51153 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB13P51153 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB13P51153 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB13P51153 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB13P51153 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB13P51153 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB13P51153 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB13P51153 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB13P51153 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB13P51153 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB13P51153 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB13P51153 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB13P51153 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms