Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLCSP50747 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLCSP50747 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLCSP50747 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLCSP50747 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLCSP50747 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLCSP50747 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HLCSP50747 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLCSP50747 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLCSP50747 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLCSP50747 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLCSP50747 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLCSP50747 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLCSP50747 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLCSP50747 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLCSP50747 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLCSP50747 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLCSP50747 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLCSP50747 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLCSP50747 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLCSP50747 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLCSP50747 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLCSP50747 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLCSP50747 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLCSP50747 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLCSP50747 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLCSP50747 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLCSP50747 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLCSP50747 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLCSP50747 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLCSP50747 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLCSP50747 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLCSP50747 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLCSP50747 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLCSP50747 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLCSP50747 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLCSP50747 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLCSP50747 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLCSP50747 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HLCSP50747 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLCSP50747 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLCSP50747 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLCSP50747 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLCSP50747 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLCSP50747 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLCSP50747 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLCSP50747 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLCSP50747 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLCSP50747 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLCSP50747 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HLCSP50747 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLCSP50747 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLCSP50747 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLCSP50747 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HLCSP50747 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLCSP50747 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLCSP50747 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLCSP50747 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLCSP50747 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLCSP50747 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLCSP50747 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLCSP50747 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLCSP50747 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLCSP50747 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLCSP50747 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLCSP50747 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLCSP50747 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLCSP50747 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLCSP50747 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLCSP50747 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLCSP50747 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HLCSP50747 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLCSP50747 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLCSP50747 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLCSP50747 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLCSP50747 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLCSP50747 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLCSP50747 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLCSP50747 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLCSP50747 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLCSP50747 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLCSP50747 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLCSP50747 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLCSP50747 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLCSP50747 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLCSP50747 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLCSP50747 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLCSP50747 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLCSP50747 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLCSP50747 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLCSP50747 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLCSP50747 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLCSP50747 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLCSP50747 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HLCSP50747 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLCSP50747 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLCSP50747 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLCSP50747 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLCSP50747 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLCSP50747 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms