Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASCL1P50553 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASCL1P50553 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ASCL1P50553 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASCL1P50553 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASCL1P50553 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ASCL1P50553 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASCL1P50553 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASCL1P50553 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASCL1P50553 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASCL1P50553 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASCL1P50553 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASCL1P50553 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASCL1P50553 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ASCL1P50553 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASCL1P50553 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ASCL1P50553 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASCL1P50553 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms