Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSEN1P49768 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSEN1P49768 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSEN1P49768 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSEN1P49768 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSEN1P49768 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSEN1P49768 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSEN1P49768 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSEN1P49768 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSEN1P49768 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSEN1P49768 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSEN1P49768 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSEN1P49768 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSEN1P49768 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSEN1P49768 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSEN1P49768 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSEN1P49768 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSEN1P49768 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSEN1P49768 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSEN1P49768 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSEN1P49768 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSEN1P49768 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSEN1P49768 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSEN1P49768 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSEN1P49768 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSEN1P49768 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSEN1P49768 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms