Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2AP49459 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2AP49459 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2AP49459 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2AP49459 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2AP49459 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2AP49459 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2AP49459 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2AP49459 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2AP49459 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms