Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU3F4P49335 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU3F4P49335 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POU3F4P49335 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POU3F4P49335 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POU3F4P49335 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POU3F4P49335 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POU3F4P49335 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POU3F4P49335 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POU3F4P49335 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU3F4P49335 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU3F4P49335 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POU3F4P49335 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU3F4P49335 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU3F4P49335 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU3F4P49335 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU3F4P49335 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU3F4P49335 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POU3F4P49335 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU3F4P49335 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU3F4P49335 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POU3F4P49335 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU3F4P49335 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms