Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPIAP49247 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPIAP49247 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPIAP49247 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPIAP49247 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPIAP49247 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPIAP49247 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPIAP49247 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPIAP49247 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RPIAP49247 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPIAP49247 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPIAP49247 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPIAP49247 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPIAP49247 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPIAP49247 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPIAP49247 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPIAP49247 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPIAP49247 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPIAP49247 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPIAP49247 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPIAP49247 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPIAP49247 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPIAP49247 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPIAP49247 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPIAP49247 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPIAP49247 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPIAP49247 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPIAP49247 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPIAP49247 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPIAP49247 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPIAP49247 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPIAP49247 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPIAP49247 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPIAP49247 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPIAP49247 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPIAP49247 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPIAP49247 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPIAP49247 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPIAP49247 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPIAP49247 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPIAP49247 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPIAP49247 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPIAP49247 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPIAP49247 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPIAP49247 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPIAP49247 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPIAP49247 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPIAP49247 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPIAP49247 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPIAP49247 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPIAP49247 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPIAP49247 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPIAP49247 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPIAP49247 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPIAP49247 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPIAP49247 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPIAP49247 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPIAP49247 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPIAP49247 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPIAP49247 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPIAP49247 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPIAP49247 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPIAP49247 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPIAP49247 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPIAP49247 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPIAP49247 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPIAP49247 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RPIAP49247 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPIAP49247 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPIAP49247 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPIAP49247 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPIAP49247 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPIAP49247 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPIAP49247 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPIAP49247 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPIAP49247 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPIAP49247 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPIAP49247 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPIAP49247 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPIAP49247 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPIAP49247 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPIAP49247 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPIAP49247 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPIAP49247 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPIAP49247 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPIAP49247 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPIAP49247 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPIAP49247 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPIAP49247 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPIAP49247 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPIAP49247 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPIAP49247 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPIAP49247 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPIAP49247 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPIAP49247 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPIAP49247 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPIAP49247 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPIAP49247 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPIAP49247 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPIAP49247 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms