Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3CGP48736 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CGP48736 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3CGP48736 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PIK3CGP48736 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3CGP48736 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CGP48736 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CGP48736 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3CGP48736 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3CGP48736 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3CGP48736 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PIK3CGP48736 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CGP48736 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms