Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A9P48067 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A9P48067 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A9P48067 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A9P48067 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A9P48067 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A9P48067 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A9P48067 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A9P48067 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A9P48067 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A9P48067 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A9P48067 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A9P48067 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms