Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIA4P48058 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIA4P48058 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIA4P48058 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIA4P48058 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIA4P48058 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIA4P48058 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIA4P48058 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIA4P48058 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIA4P48058 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIA4P48058 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIA4P48058 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIA4P48058 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIA4P48058 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIA4P48058 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIA4P48058 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIA4P48058 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIA4P48058 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIA4P48058 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIA4P48058 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIA4P48058 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIA4P48058 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIA4P48058 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA4P48058 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIA4P48058 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIA4P48058 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIA4P48058 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms