Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP42356 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP42356 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PI4KAP42356 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP42356 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP42356 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP42356 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PI4KAP42356 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PI4KAP42356 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PI4KAP42356 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PI4KAP42356 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PI4KAP42356 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PI4KAP42356 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PI4KAP42356 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PI4KAP42356 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PI4KAP42356 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PI4KAP42356 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PI4KAP42356 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PI4KAP42356 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PI4KAP42356 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PI4KAP42356 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PI4KAP42356 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PI4KAP42356 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PI4KAP42356 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PI4KAP42356 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PI4KAP42356 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PI4KAP42356 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PI4KAP42356 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PI4KAP42356 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PI4KAP42356 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PI4KAP42356 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PI4KAP42356 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms