Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
ITGAEP38570 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ITGAEP38570 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ITGAEP38570 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ITGAEP38570 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ITGAEP38570 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
ITGAEP38570 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ITGAEP38570 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ITGAEP38570 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ITGAEP38570 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ITGAEP38570 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
ITGAEP38570 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ITGAEP38570 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ITGAEP38570 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ITGAEP38570 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ITGAEP38570 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ITGAEP38570 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ITGAEP38570 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ITGAEP38570 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
ITGAEP38570 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ITGAEP38570 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ITGAEP38570 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ITGAEP38570 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ITGAEP38570 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ITGAEP38570 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ITGAEP38570 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ITGAEP38570 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
ITGAEP38570 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ITGAEP38570 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
ITGAEP38570 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ITGAEP38570 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
ITGAEP38570 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
ITGAEP38570 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ITGAEP38570 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ITGAEP38570 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ITGAEP38570 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ITGAEP38570 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ITGAEP38570 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
ITGAEP38570 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ITGAEP38570 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ITGAEP38570 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ITGAEP38570 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ITGAEP38570 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ITGAEP38570 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ITGAEP38570 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
ITGAEP38570 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ITGAEP38570 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ITGAEP38570 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ITGAEP38570 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ITGAEP38570 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ITGAEP38570 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ITGAEP38570 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ITGAEP38570 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ITGAEP38570 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ITGAEP38570 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ITGAEP38570 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ITGAEP38570 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ITGAEP38570 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ITGAEP38570 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ITGAEP38570 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ITGAEP38570 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ITGAEP38570 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ITGAEP38570 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ITGAEP38570 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ITGAEP38570 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ITGAEP38570 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ITGAEP38570 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ITGAEP38570 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ITGAEP38570 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ITGAEP38570 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ITGAEP38570 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ITGAEP38570 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms