Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT20P35900 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT20P35900 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT20P35900 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT20P35900 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT20P35900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT20P35900 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT20P35900 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT20P35900 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT20P35900 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT20P35900 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT20P35900 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT20P35900 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT20P35900 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT20P35900 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT20P35900 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT20P35900 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT20P35900 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT20P35900 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT20P35900 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT20P35900 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT20P35900 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT20P35900 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT20P35900 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT20P35900 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT20P35900 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT20P35900 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT20P35900 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT20P35900 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT20P35900 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT20P35900 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT20P35900 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT20P35900 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT20P35900 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT20P35900 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT20P35900 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT20P35900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT20P35900 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT20P35900 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT20P35900 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT20P35900 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT20P35900 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT20P35900 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT20P35900 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT20P35900 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT20P35900 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT20P35900 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT20P35900 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT20P35900 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT20P35900 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT20P35900 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT20P35900 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT20P35900 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT20P35900 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT20P35900 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT20P35900 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT20P35900 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT20P35900 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT20P35900 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT20P35900 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT20P35900 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT20P35900 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT20P35900 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT20P35900 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT20P35900 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT20P35900 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT20P35900 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT20P35900 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT20P35900 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT20P35900 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT20P35900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT20P35900 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT20P35900 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT20P35900 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT20P35900 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT20P35900 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT20P35900 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT20P35900 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT20P35900 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT20P35900 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT20P35900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT20P35900 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT20P35900 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT20P35900 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT20P35900 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT20P35900 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT20P35900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT20P35900 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT20P35900 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT20P35900 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT20P35900 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT20P35900 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT20P35900 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT20P35900 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT20P35900 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT20P35900 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT20P35900 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT20P35900 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT20P35900 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT20P35900 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms