Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRR1AP35321 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPRR1AP35321 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRR1AP35321 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPRR1AP35321 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPRR1AP35321 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPRR1AP35321 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms