Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTNNA1P35221 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTNNA1P35221 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA1P35221 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNNA1P35221 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA1P35221 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA1P35221 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA1P35221 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA1P35221 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA1P35221 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA1P35221 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNA1P35221 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA1P35221 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNA1P35221 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA1P35221 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA1P35221 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA1P35221 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA1P35221 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNNA1P35221 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNNA1P35221 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTNNA1P35221 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTNNA1P35221 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA1P35221 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA1P35221 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA1P35221 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNA1P35221 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNA1P35221 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNA1P35221 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTNNA1P35221 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA1P35221 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms