Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNA8P32881 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNA8P32881 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNA8P32881 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFNA8P32881 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNA8P32881 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNA8P32881 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNA8P32881 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNA8P32881 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNA8P32881 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNA8P32881 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNA8P32881 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNA8P32881 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNA8P32881 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNA8P32881 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNA8P32881 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNA8P32881 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNA8P32881 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNA8P32881 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNA8P32881 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNA8P32881 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNA8P32881 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNA8P32881 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNA8P32881 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNA8P32881 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms