Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CPS1P31327 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CPS1P31327 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CPS1P31327 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
CPS1P31327 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CPS1P31327 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CPS1P31327 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CPS1P31327 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CPS1P31327 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CPS1P31327 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
CPS1P31327 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CPS1P31327 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CPS1P31327 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CPS1P31327 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CPS1P31327 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CPS1P31327 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CPS1P31327 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CPS1P31327 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CPS1P31327 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CPS1P31327 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CPS1P31327 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CPS1P31327 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CPS1P31327 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CPS1P31327 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CPS1P31327 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CPS1P31327 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CPS1P31327 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CPS1P31327 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CPS1P31327 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CPS1P31327 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CPS1P31327 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CPS1P31327 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CPS1P31327 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CPS1P31327 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CPS1P31327 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CPS1P31327 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CPS1P31327 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CPS1P31327 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CPS1P31327 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CPS1P31327 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CPS1P31327 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
CPS1P31327 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CPS1P31327 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CPS1P31327 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CPS1P31327 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CPS1P31327 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CPS1P31327 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CPS1P31327 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CPS1P31327 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CPS1P31327 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CPS1P31327 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CPS1P31327 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CPS1P31327 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CPS1P31327 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CPS1P31327 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CPS1P31327 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CPS1P31327 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CPS1P31327 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CPS1P31327 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CPS1P31327 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CPS1P31327 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CPS1P31327 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CPS1P31327 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CPS1P31327 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CPS1P31327 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CPS1P31327 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CPS1P31327 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CPS1P31327 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CPS1P31327 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CPS1P31327 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CPS1P31327 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CPS1P31327 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CPS1P31327 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CPS1P31327 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CPS1P31327 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CPS1P31327 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CPS1P31327 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CPS1P31327 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CPS1P31327 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CPS1P31327 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CPS1P31327 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CPS1P31327 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CPS1P31327 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CPS1P31327 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CPS1P31327 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CPS1P31327 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CPS1P31327 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CPS1P31327 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
CPS1P31327 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CPS1P31327 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CPS1P31327 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CPS1P31327 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CPS1P31327 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CPS1P31327 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CPS1P31327 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CPS1P31327 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CPS1P31327 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CPS1P31327 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CPS1P31327 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CPS1P31327 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms