Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC13P31276 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC13P31276 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC13P31276 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC13P31276 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC13P31276 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC13P31276 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC13P31276 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC13P31276 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXC13P31276 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXC13P31276 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXC13P31276 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXC13P31276 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXC13P31276 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC13P31276 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXC13P31276 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC13P31276 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC13P31276 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC13P31276 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC13P31276 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC13P31276 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC13P31276 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HOXC13P31276 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXC13P31276 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXC13P31276 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXC13P31276 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXC13P31276 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HOXC13P31276 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXC13P31276 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC13P31276 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC13P31276 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXC13P31276 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC13P31276 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms