Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJB2P29033 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJB2P29033 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJB2P29033 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GJB2P29033 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJB2P29033 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GJB2P29033 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GJB2P29033 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GJB2P29033 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJB2P29033 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJB2P29033 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJB2P29033 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJB2P29033 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJB2P29033 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJB2P29033 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJB2P29033 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJB2P29033 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GJB2P29033 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GJB2P29033 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GJB2P29033 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GJB2P29033 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJB2P29033 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GJB2P29033 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GJB2P29033 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GJB2P29033 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GJB2P29033 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJB2P29033 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJB2P29033 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJB2P29033 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJB2P29033 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJB2P29033 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJB2P29033 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJB2P29033 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJB2P29033 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJB2P29033 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJB2P29033 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJB2P29033 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJB2P29033 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GJB2P29033 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJB2P29033 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJB2P29033 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJB2P29033 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GJB2P29033 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GJB2P29033 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GJB2P29033 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GJB2P29033 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GJB2P29033 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJB2P29033 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJB2P29033 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJB2P29033 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJB2P29033 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
GJB2P29033 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJB2P29033 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJB2P29033 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJB2P29033 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJB2P29033 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJB2P29033 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJB2P29033 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJB2P29033 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJB2P29033 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJB2P29033 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJB2P29033 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJB2P29033 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJB2P29033 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GJB2P29033 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJB2P29033 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJB2P29033 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJB2P29033 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJB2P29033 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJB2P29033 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GJB2P29033 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GJB2P29033 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GJB2P29033 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJB2P29033 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GJB2P29033 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJB2P29033 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJB2P29033 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJB2P29033 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJB2P29033 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJB2P29033 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJB2P29033 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJB2P29033 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJB2P29033 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJB2P29033 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJB2P29033 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJB2P29033 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GJB2P29033 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GJB2P29033 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJB2P29033 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJB2P29033 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJB2P29033 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJB2P29033 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJB2P29033 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJB2P29033 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GJB2P29033 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJB2P29033 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GJB2P29033 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJB2P29033 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJB2P29033 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJB2P29033 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms