Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTR1EP28566 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTR1EP28566 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTR1EP28566 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTR1EP28566 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTR1EP28566 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTR1EP28566 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HTR1EP28566 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR1EP28566 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR1EP28566 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR1EP28566 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HTR1EP28566 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTR1EP28566 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR1EP28566 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR1EP28566 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR1EP28566 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR1EP28566 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR1EP28566 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR1EP28566 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR1EP28566 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR1EP28566 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR1EP28566 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR1EP28566 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR1EP28566 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR1EP28566 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR1EP28566 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR1EP28566 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR1EP28566 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTR1EP28566 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTR1EP28566 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTR1EP28566 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms