Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTNNA2P26232 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA2P26232 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CTNNA2P26232 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNNA2P26232 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA2P26232 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA2P26232 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA2P26232 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA2P26232 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA2P26232 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNA2P26232 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNA2P26232 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNA2P26232 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA2P26232 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA2P26232 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNA2P26232 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA2P26232 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA2P26232 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA2P26232 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CTNNA2P26232 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNA2P26232 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNA2P26232 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNA2P26232 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNA2P26232 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA2P26232 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA2P26232 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTNNA2P26232 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA2P26232 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNA2P26232 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms