Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3AP20336 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3AP20336 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3AP20336 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3AP20336 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3AP20336 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3AP20336 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3AP20336 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB3AP20336 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3AP20336 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3AP20336 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3AP20336 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3AP20336 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3AP20336 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3AP20336 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3AP20336 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms