Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3AP20336 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB3AP20336 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB3AP20336 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3AP20336 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3AP20336 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3AP20336 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3AP20336 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3AP20336 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB3AP20336 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3AP20336 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3AP20336 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3AP20336 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3AP20336 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3AP20336 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3AP20336 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3AP20336 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3AP20336 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3AP20336 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB3AP20336 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3AP20336 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3AP20336 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3AP20336 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB3AP20336 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3AP20336 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3AP20336 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3AP20336 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3AP20336 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3AP20336 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3AP20336 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3AP20336 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3AP20336 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3AP20336 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3AP20336 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3AP20336 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB3AP20336 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3AP20336 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3AP20336 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3AP20336 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3AP20336 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3AP20336 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB3AP20336 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3AP20336 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3AP20336 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3AP20336 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3AP20336 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3AP20336 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3AP20336 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3AP20336 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3AP20336 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3AP20336 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3AP20336 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3AP20336 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3AP20336 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3AP20336 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3AP20336 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3AP20336 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3AP20336 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RAB3AP20336 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3AP20336 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3AP20336 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3AP20336 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3AP20336 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3AP20336 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3AP20336 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3AP20336 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3AP20336 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3AP20336 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3AP20336 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3AP20336 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3AP20336 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3AP20336 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3AP20336 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3AP20336 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3AP20336 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3AP20336 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3AP20336 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3AP20336 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3AP20336 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3AP20336 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3AP20336 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3AP20336 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3AP20336 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3AP20336 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3AP20336 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3AP20336 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3AP20336 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3AP20336 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3AP20336 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3AP20336 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3AP20336 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms