Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN8P19075 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN8P19075 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TSPAN8P19075 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN8P19075 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN8P19075 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN8P19075 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN8P19075 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TSPAN8P19075 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN8P19075 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN8P19075 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSPAN8P19075 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSPAN8P19075 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN8P19075 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN8P19075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN8P19075 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN8P19075 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN8P19075 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSPAN8P19075 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN8P19075 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN8P19075 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN8P19075 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN8P19075 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms