Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCC1P18754 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCC1P18754 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCC1P18754 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCC1P18754 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCC1P18754 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCC1P18754 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCC1P18754 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCC1P18754 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCC1P18754 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCC1P18754 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCC1P18754 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCC1P18754 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCC1P18754 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCC1P18754 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC1P18754 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCC1P18754 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCC1P18754 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC1P18754 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC1P18754 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC1P18754 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC1P18754 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC1P18754 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCC1P18754 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCC1P18754 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCC1P18754 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCC1P18754 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCC1P18754 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCC1P18754 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCC1P18754 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCC1P18754 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCC1P18754 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCC1P18754 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCC1P18754 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC1P18754 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC1P18754 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC1P18754 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC1P18754 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC1P18754 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCC1P18754 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCC1P18754 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCC1P18754 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCC1P18754 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCC1P18754 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCC1P18754 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCC1P18754 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCC1P18754 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCC1P18754 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCC1P18754 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCC1P18754 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCC1P18754 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCC1P18754 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCC1P18754 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCC1P18754 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCC1P18754 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCC1P18754 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCC1P18754 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCC1P18754 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCC1P18754 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCC1P18754 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC1P18754 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC1P18754 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC1P18754 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC1P18754 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC1P18754 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCC1P18754 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCC1P18754 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCC1P18754 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCC1P18754 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCC1P18754 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCC1P18754 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCC1P18754 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCC1P18754 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCC1P18754 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCC1P18754 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCC1P18754 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCC1P18754 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCC1P18754 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCC1P18754 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCC1P18754 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCC1P18754 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCC1P18754 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RCC1P18754 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCC1P18754 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCC1P18754 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCC1P18754 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCC1P18754 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCC1P18754 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCC1P18754 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCC1P18754 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCC1P18754 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCC1P18754 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RCC1P18754 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCC1P18754 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCC1P18754 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCC1P18754 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCC1P18754 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCC1P18754 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCC1P18754 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCC1P18754 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms