Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GM2AP17900 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GM2AP17900 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GM2AP17900 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GM2AP17900 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GM2AP17900 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GM2AP17900 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GM2AP17900 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GM2AP17900 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GM2AP17900 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GM2AP17900 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GM2AP17900 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GM2AP17900 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GM2AP17900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GM2AP17900 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GM2AP17900 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GM2AP17900 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GM2AP17900 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GM2AP17900 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GM2AP17900 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GM2AP17900 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GM2AP17900 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GM2AP17900 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GM2AP17900 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GM2AP17900 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GM2AP17900 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GM2AP17900 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GM2AP17900 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GM2AP17900 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GM2AP17900 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GM2AP17900 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GM2AP17900 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GM2AP17900 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GM2AP17900 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GM2AP17900 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GM2AP17900 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GM2AP17900 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GM2AP17900 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GM2AP17900 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GM2AP17900 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GM2AP17900 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GM2AP17900 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GM2AP17900 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GM2AP17900 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GM2AP17900 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GM2AP17900 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GM2AP17900 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GM2AP17900 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GM2AP17900 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GM2AP17900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GM2AP17900 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GM2AP17900 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GM2AP17900 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GM2AP17900 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GM2AP17900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GM2AP17900 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GM2AP17900 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GM2AP17900 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GM2AP17900 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GM2AP17900 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GM2AP17900 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GM2AP17900 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GM2AP17900 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GM2AP17900 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GM2AP17900 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GM2AP17900 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GM2AP17900 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GM2AP17900 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GM2AP17900 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GM2AP17900 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GM2AP17900 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GM2AP17900 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GM2AP17900 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GM2AP17900 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GM2AP17900 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GM2AP17900 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GM2AP17900 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GM2AP17900 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GM2AP17900 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GM2AP17900 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GM2AP17900 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GM2AP17900 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GM2AP17900 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GM2AP17900 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GM2AP17900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GM2AP17900 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GM2AP17900 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GM2AP17900 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GM2AP17900 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GM2AP17900 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GM2AP17900 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GM2AP17900 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GM2AP17900 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GM2AP17900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GM2AP17900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GM2AP17900 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GM2AP17900 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GM2AP17900 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GM2AP17900 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GM2AP17900 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms