Protein–RNA interactions for Protein: P17568

NDUFB7, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB7P17568 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFB7P17568 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFB7P17568 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFB7P17568 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFB7P17568 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFB7P17568 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFB7P17568 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFB7P17568 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB7P17568 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NDUFB7P17568 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFB7P17568 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB7P17568 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFB7P17568 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms