Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRA1P14867 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRA1P14867 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA1P14867 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA1P14867 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA1P14867 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRA1P14867 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRA1P14867 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRA1P14867 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRA1P14867 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRA1P14867 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRA1P14867 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRA1P14867 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRA1P14867 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA1P14867 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRA1P14867 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRA1P14867 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRA1P14867 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRA1P14867 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRA1P14867 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRA1P14867 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRA1P14867 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRA1P14867 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRA1P14867 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRA1P14867 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRA1P14867 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms