Protein–RNA interactions for Protein: P14780

MMP9, Matrix metalloproteinase-9, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP9P14780 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP9P14780 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP9P14780 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP9P14780 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP9P14780 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP9P14780 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP9P14780 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP9P14780 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP9P14780 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP9P14780 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP9P14780 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP9P14780 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP9P14780 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP9P14780 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP9P14780 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP9P14780 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP9P14780 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP9P14780 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP9P14780 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP9P14780 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP9P14780 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP9P14780 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP9P14780 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP9P14780 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP9P14780 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP9P14780 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP9P14780 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP9P14780 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP9P14780 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP9P14780 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP9P14780 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP9P14780 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP9P14780 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP9P14780 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP9P14780 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP9P14780 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP9P14780 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP9P14780 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP9P14780 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP9P14780 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP9P14780 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP9P14780 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP9P14780 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP9P14780 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP9P14780 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP9P14780 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP9P14780 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP9P14780 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP9P14780 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP9P14780 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP9P14780 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP9P14780 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP9P14780 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP9P14780 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP9P14780 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP9P14780 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP9P14780 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP9P14780 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP9P14780 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP9P14780 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP9P14780 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP9P14780 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP9P14780 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP9P14780 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP9P14780 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP9P14780 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP9P14780 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP9P14780 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP9P14780 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP9P14780 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP9P14780 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP9P14780 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP9P14780 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP9P14780 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP9P14780 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP9P14780 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP9P14780 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP9P14780 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP9P14780 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP9P14780 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP9P14780 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP9P14780 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP9P14780 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP9P14780 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP9P14780 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP9P14780 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP9P14780 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP9P14780 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP9P14780 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP9P14780 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP9P14780 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP9P14780 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP9P14780 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP9P14780 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP9P14780 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP9P14780 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP9P14780 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP9P14780 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP9P14780 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP9P14780 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms