Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRF1P14222 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRF1P14222 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRF1P14222 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRF1P14222 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRF1P14222 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRF1P14222 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRF1P14222 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRF1P14222 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRF1P14222 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRF1P14222 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRF1P14222 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRF1P14222 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRF1P14222 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRF1P14222 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRF1P14222 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRF1P14222 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRF1P14222 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRF1P14222 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRF1P14222 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRF1P14222 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRF1P14222 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRF1P14222 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRF1P14222 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRF1P14222 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRF1P14222 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRF1P14222 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRF1P14222 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRF1P14222 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRF1P14222 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRF1P14222 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRF1P14222 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRF1P14222 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRF1P14222 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRF1P14222 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRF1P14222 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRF1P14222 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRF1P14222 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRF1P14222 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRF1P14222 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRF1P14222 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRF1P14222 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRF1P14222 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRF1P14222 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRF1P14222 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRF1P14222 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRF1P14222 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRF1P14222 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRF1P14222 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRF1P14222 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRF1P14222 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRF1P14222 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRF1P14222 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRF1P14222 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRF1P14222 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRF1P14222 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRF1P14222 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRF1P14222 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRF1P14222 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRF1P14222 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRF1P14222 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRF1P14222 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRF1P14222 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRF1P14222 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRF1P14222 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRF1P14222 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRF1P14222 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRF1P14222 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRF1P14222 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRF1P14222 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRF1P14222 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRF1P14222 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRF1P14222 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRF1P14222 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRF1P14222 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRF1P14222 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRF1P14222 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRF1P14222 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRF1P14222 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRF1P14222 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRF1P14222 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRF1P14222 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRF1P14222 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRF1P14222 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRF1P14222 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRF1P14222 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRF1P14222 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRF1P14222 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRF1P14222 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRF1P14222 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRF1P14222 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRF1P14222 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRF1P14222 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRF1P14222 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRF1P14222 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRF1P14222 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRF1P14222 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRF1P14222 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRF1P14222 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRF1P14222 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 708 ms